AustralieFrV1, Main, Exploration, bibRecord, 00B267

Assessment of two highly polymorphic microsatellite loci in 103 accessions of vitis species

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Assessment of two highly polymorphic microsatellite loci in 103 accessions of vitis species

Auteurs : F. Lefort [Suisse] ; F. Pelsy [France] ; L. Schehrer [France] ; K. D. Scott [Australie] ; D. Merdinoglu [France]

Source :

Journal international des sciences de la vigne et du vin [ 1151-0285 ] ; 2003.

RBID : Pascal:04-0146962

Descripteurs français

Pascal (Inist)
- Génétique, Variabilité génétique, Séquence nucléotide, Séquence répétée, Identification génétique, Etude comparative, Etude expérimentale, Vitis vinifera, Vitis, Porte greffe, DNA microsatellite.
Wicri :
- topic : Génétique.

English descriptors

KwdEn :
- Comparative study, Experimental study, Genetic identification, Genetic variability, Genetics, Microsatellite DNA, Nucleotide sequence, Repeated sequence, Rootstock, Vitis, Vitis vinifera.

Abstract

Nous avons évalué le pouvoir discriminant de deux loci microsatellites nucléaires (SSRn, séquences simples répétées), ssrVvUCH12 et ssrVvUCH29, que l'on suspectait être hautement polymorphe et receler des allèles spécifiques, d'après un précédent travail de caractérisation. Comme le génotypage d'un plus grand nombre de plantes à un plus grand nombre de loci était nécessaire pour en permettre une comparaison plus étendue, 103 accessions de Vitis vinifera, d'autres espèces de Vitis ci de 3 genres apparentés ont été soumises au profilage par microsatellites à 14 loci microsatellites nucléaires, incluant ssrVvUCH 12 et vsrVvUCH29. Au total, 30 allèles ont été caractérisés pour chacun des deux loci ssrVvUCH 12 et vsrVvUCH29 dans les 103 accessions. Les deux loci les plus polymorphes parmi les 12 autres loci analysés étaient ssrVrZAG93 et VMc8a7 et avaient respectivement 21 et 23 allèles dans les 103 accessions analysées au total. Ces deux demier loci ont par contre le désavantage d'afficher de façon reproductive un profil à trois allèles dans un certain nombre d'accessions, signe probable de chimérisme. Il est aussi particulièrement intéressant que la similarité moyenne calculée pour les 103 accessions analysées avec la combinaison des deux loci ssrVvUCH 12-ssrV vUCH29 ait été trouvée inférieure à celle obtenue avec la combinaison ssrVrZAG93-VMC8a7. Par contre l'héiérozygotie obtenue avec la combinaison ssrVvUCH 12-ssrVvUCH29 était supérieure à celle obtenue avec la combinaison ssrVrZAG93-VMC8a7. Les comparaisons entre les deux combinaisons de loci ont été visualisés sous la forme de phénogrammes UPGMA pour les 103 accessions et pour des sous-groupes au sein de ces 103 accessions. Dans chaque cas de comparaison, la combinaison ssrVvUCH 12-ssrVvUCH29 était toujours la plus avantageuse en terme de discrimination. De plus de nombreux allèles spécifiques ont été découverts pour des porte-greffes et des espèces de Vitis autre que V. vinifera, aux loci ssrVvUCHI2 et ssrVvUCH29, alors qu'il y en avait peu pour les deux autres loci. Ces caractéristiques permettent de penser que ces deux loci très polymorphes pourraient être considérés pour la gestion des collections ampélographiques, en combinaison avec les lori microsatellites déjà en usage. Ils pourraient également être intéressants comme outils de contrôle de qualité de certains porte-greffes dans les pépinières ou lors d'échanges commerciaux.

Affiliations:

Australie, France, Suisse

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